Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms