Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX12Q9UMY4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms