Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB23Q9ULC3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB23Q9ULC3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms