Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms