Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPHA6Q9UF33 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms