Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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