Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms