Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms