Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TOR4AQ9NXH8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms