Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms