Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms