Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms