Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms