Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms