Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms