Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPO3Q9BXY4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms