Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms