Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB6Q9BUF5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB6Q9BUF5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms