Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms