Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms