Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms