Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms