Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71F1Q96KD3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms