Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms