Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms