Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms