Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.78e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 SPHK2-205ENST00000597434 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.78■□□□□ 0.448e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.326e-15■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.276e-15■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.258e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TMEM44-205ENST00000419280 1212 ntTSL 516.57■□□□□ 0.248e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.236e-15■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 515.78■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.096e-15■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.088e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.048e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.026e-15■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TMEM44-214ENST00000494894 859 ntTSL 315.12■□□□□ 0.018e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TMEM44-209ENST00000452358 846 ntTSL 314.03□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.188e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.258e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 ADGRD1-203ENST00000376682 4135 ntTSL 212.34□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.646e-15■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 BCL6-203ENST00000419510 4178 ntTSL 29.09□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 SESTD1-202ENST00000426988 724 ntTSL 35.43□□□□□ -1.546e-7■■■■■ 37.3
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TBRG4Q969Z0 SBF2-214ENST00000533770 4829 ntTSL 1 (best)3.29□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.956e-15■■■■■ 37.3
TBRG4Q969Z0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 37.1
TBRG4Q969Z0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.194e-6■■■■■ 37
TBRG4Q969Z0 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 216.48■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 37
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TBRG4Q969Z0 ADGRE2-202ENST00000360222 3330 ntTSL 210.06□□□□□ -0.88e-9■■■■■ 37
TBRG4Q969Z0 ADGRE2-212ENST00000601345 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.898e-9■■■■■ 37
TBRG4Q969Z0 TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 915 ntTSL 1 (best)26.62■■□□□ 1.858e-9■■■■■ 36.9
TBRG4Q969Z0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.178e-9■■■■■ 36.9
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TBRG4Q969Z0 MAPK3-207ENST00000466521 1878 ntTSL 529.43■■■□□ 2.39e-7■■■■■ 36.9
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TBRG4Q969Z0 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 36.8
TBRG4Q969Z0 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 36.8
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TBRG4Q969Z0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 36.7
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TBRG4Q969Z0 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 36.7
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TBRG4Q969Z0 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 36.7
TBRG4Q969Z0 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 36.7
TBRG4Q969Z0 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -12e-6■■■■■ 36.7
TBRG4Q969Z0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.075e-10■■■■■ 36.7
TBRG4Q969Z0 HS6ST1-204ENST00000494089 585 ntTSL 217.27■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 HS6ST1-203ENST00000469019 559 ntTSL 414.88□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 TMEM51-206ENST00000451326 766 ntTSL 314.66□□□□□ -0.065e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-207ENST00000502487 1346 ntTSL 1 (best)26■■□□□ 1.751e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.531e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.272e-8■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-215ENST00000530093 414 ntTSL 422.67■■□□□ 1.223e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-213ENST00000529346 1718 ntTSL 222.44■■□□□ 1.183e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.163e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.073e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-209ENST00000527199 540 ntTSL 321.39■■□□□ 1.013e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-210ENST00000527807 814 ntTSL 521.39■■□□□ 1.013e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-211ENST00000513545 775 ntTSL 321.24■□□□□ 0.991e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-224ENST00000533500 587 ntTSL 320.68■□□□□ 0.93e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 520.2■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-229ENST00000534755 474 ntTSL 420■□□□□ 0.793e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-203ENST00000524763 580 ntTSL 318.67■□□□□ 0.583e-11■■■■■ 36.6
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