Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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GTF3C6Q969F1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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GTF3C6Q969F1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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GTF3C6Q969F1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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GTF3C6Q969F1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C6Q969F1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
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