Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP3Q8WYN3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP3Q8WYN3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms