Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL22A1Q8NFW1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL22A1Q8NFW1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms