Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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