Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP4Q8N2S1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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