Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms