Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms