Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMB4Q86W47 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms