Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms