Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms