Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACS1Q6VY07 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms