Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZCCHC12Q6PEW1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms