Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDD2Q6NTF9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms