Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms