Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNT1Q5JUK3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms