Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms