Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PYDC2Q56P42 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms