Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms