Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms