Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FHOD3Q2V2M9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms