Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAQ29983 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MICAQ29983 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MICAQ29983 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MICAQ29983 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MICAQ29983 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MICAQ29983 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MICAQ29983 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MICAQ29983 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MICAQ29983 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MICAQ29983 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MICAQ29983 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms