Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYPL1Q16563 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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