Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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